Ein wichtiger Faktor bei der Bereitstellung und Aufrechterhaltung digitaler Sammlungen ist die Verhinderung von Link-Rot oder wenn ein angeklickter Link nicht mehr funktioniert. Dies wird mit einem dauerhaften persistenten Identifikator (PID) angegangen. Dadurch bleiben digitale Objekte immer am gleichen Ort online verfügbar. KLEKSI generiert seine eigenen PIDs und unterstützt auch PIDs vom Handle System.